自2008年以来，两岸关系和平发展不仅造福两岸人民，也使地区国家分享了和平红利。但是，2016年1月台湾地区领导人和立法机关选举后，两岸关系发展出现了诸多不确定因素。
首先，两岸关系和平发展的政治基础能否得到维护？2015年11月7日，习近平主席在新加坡与台湾地区领导人马英九会面时指出，7年来两岸关系能够实现发展，关键在于双方确立了坚持“九二共识”、反对“台独”的共同政治基础。没有和平这个定海神针，和平发展之舟就会遭遇惊涛骇浪，甚至彻底倾覆。民进党蔡英文在2016年1月举行的台湾地区领导人选举中获胜当选，她在选前选后都没有明确表示坚持“九二共识”，反对“台独”。选前，蔡英文表示会“在中华民国现行宪政体制下，以‘维持现状’作为两岸事务的核心”，“珍惜并维护20多年来协商和交流互动所累积的成果”，“建立具有一致性、可预测且可持续的两岸关系”等，但对“九二共识”避而不谈。选后，蔡英文接受《自由时报》采访时表示，1992年，两岸两会秉持相互谅解、求同存异的政治思维进行沟通协商，达成了若干的共同认知与谅解，“我理解和尊重这个历史事实”。两岸应在这个基本事实与“既有政治基础”上，持续推动两岸关系。蔡英文说的“既有政治基础”包括：1992年两岸两会会谈的历史事实，以及双方求同存异的共同认知；台湾“现行宪政体制”；两岸过去20多年来协商和交流互动成果；台湾民主原则及普遍民意。很明显，蔡英文仍然回避了核心问题，她只承认了“九二会谈”的事实，未涉及对“九二共识”及其最为本质的“两岸同属一中”的看法。有台湾学者认为，蔡英文提“1992年会谈的历史事实”及双方“求同存异”，其实就是“九二共识”，与马英九当局立场相同，只是使用“名词”不同，这是向陆方递出橄榄枝。但是很明显，如果蔡英文对“求同存异”的本质不讲清楚，其对待两岸关系和平发展的政治基础的态度仍是模糊的，是不可信的。如果蔡英文的大陆政策停留在这个基础上，那么两岸关系和平发展的政治基础就会出问题，这是未来两岸关系发展所面临的最严重的挑战。
其次，在严重缺乏互信的情况下，两岸之间的交流和务实合作能否继续进行？自两岸关系进入和平发展轨道以来，两岸的经贸关系和人员往来日益紧密。在其中做出重要贡献的是两会协商机制。众所周知，两岸两会恢复协商谈判的前提和基础是“九二共识”，如蔡英文和民进党不承认“九二共识”，那么两会协商机制就会出现变数，这对两岸经贸关系和人员往来的继续深入发展明显不利，或者说两岸之间的交流和务实合作将停留在目前的水平上，甚至出现倒退。目前，新一届的台湾立法机构即将开议，绿营将把两岸监督条例列为优先法案，民进党党团总召柯建铭表示，两岸称谓将不会沿用“两国论”版本，而将修改为“台湾地区”和“大陆地区”。这显然是民进党在内外压力下做出的调整。但是，监督条例通过后，还面临着通过服贸、货贸协定的问题。有台湾学者预计服贸在民进党和时代力量的坚持下，将重新谈判。若果然如此，则两岸经贸合作进程又将被继续拖延，这对面临严峻挑战的台湾经济而言实在不是什么好消息。有民进党人士表示，台湾地区的经贸环境随着美韩、中韩FTA协议的执行将面临严峻挑战，服贸、货贸的通过确实有其必要性；透过服贸、货贸的通过释出与大陆的善意，大陆也应给予台湾参与多边经济的空间，争取加入TPP、RCEP及东盟10 1等经贸组织，台湾才不会遭边缘化。上述观点说明民进党完全明白服贸、货贸协定对台湾的重要意义，但仍要用“民意”、“民主”做幌子，还要用通过服贸、货贸协定和参加地区经济合作挂钩，与大陆做博弈。民进党当局只要抱持这种心态，就会继续在两岸交流与务实合作中制造麻烦。
第三，两岸共同参与地区合作能否找到务实的互动模式？目前，大陆正在全方位推动地区经济合作。一是推动RCEP谈判，争取于2016年年底取得成果；二是在“一带一路”倡议的大框架下，以“亚投行”为主要平台的地区经济、特别是基础设施建设的合作。台湾面对地区经济合作蓬勃发展的局面，如果仅仅以加入TPP为目标，以“新南向”政策为抓手，希望绕过大陆参与地区经济合作几乎是不可能实现的。民进党只有正视现实，在参加“亚投行”等问题上不迎合甚至煽动民粹，务实操作，才是对台湾经济和台商利益真正地负责任。当然，台湾参加地区经济合作始终受到政治因素影响。今年中美围绕南海问题、朝核问题等在亚太地区将互动频繁。中美构建“新型大国关系”的大框架没有变，民进党当局应该意识到在地区安全问题上没有空子可以钻。如果想利用中美关系的热点问题制造事端，那么两岸共同参与地区经济合作几乎是没有可能了。
虽然两岸关系发展存在着上述不确定因素，但由于两岸人民都期望和平，台湾岛内“台独”力量仍受到内外压力，不敢推动“法理台独”，我们有理由相信，两岸关系仍将保持和平稳定的状态，两岸人员往来和经贸关系也将继续发展。随着大陆综合实力的迅速提升，“软实力”的进一步加强，两岸关系必将朝着有利于祖国统一的方向发展。

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